Московская школа № 1164 предлагает широкий спектр программ дополнительного образования, направленных на всестороннее развитие учащихся. В школе организованы кружки, секции и факультативы по разным направлениям: естественно-научные дисциплины, языки, искусство, спорт и техническое творчество. Особое внимание уделяется развитию критического мышления, творческих способностей и практических навыков, что помогает школьникам реализовать свои интересы и пополнить знания за рамками основной учебной программы.
